После шести с половиной лет разработки увидела свет первая стабильная версия универсального SDK для химической информатики под названием Indigo. История Indigo как проекта с открытыми исходниками ведёт отсчёт от ноября 2009 года, когда был опубликован комплект утилит с ограниченным API.

На данный момент Indigo предоставляет унифицированный программный интерфейс для разработчиков на C/C++, Java, C# и Python. Краткий список возможностей:

• Поддержка форматов представления структур молекул и реакций: Molfile, Rxnfile, SDF, RDF, CML, SMILES, SMARTS
• Двумерный рендеринг структур молекул и реакций по стандартам IUPAC (в качестве движка используется cairo). Автоматическое вычисление координат атомов в 2D
• Вычисление «Canonical SMILES» — представления молекулярной структуры, инвариантного относительно перестановок атомов
• Проверка точного совпадения структур молекул или реакций (Exact matching), проверка наложения по подструктуре (Substructure matching)
• Поддержка таутомеров и резонансных форм
• Вычисление битовых кодов структур (fingerprints)
• Процедуры перебора подграфов, поддеревьев, колец в молекулярной структуре
• Вычисление молекулярного веса и молекулярной формулы
• Разложение структур по заместителям (R-Group deconvolution). Автоматическое определение максимальной общей подструктуры (MCS) множества структур.
• Комбинаторный перебор продуктов химической реакции

На основе Indigo создан Bingo — картридж для Oracle и MS SQL Server, представляющий возможности Indigo пользователям этих реляционных СУБД; в первую очередь быстрый поиск структур молекул и реакций по подструктуре и по SMARTS-выражению. Картридж для PostgreSQL находится в разработке.

Также на основе Indigo созданы следующие небольшие утилиты:

• indigo-depict — для рендеринга молекул и реакций в PNG/SVG/PDF/EPS
• indigo-cano — для вычисления Canonical SMILES
• indigo-deco — для разложения структур по заместителям
• ChemDiff — для просмотра структур и нахождения различий между двумя наборами структур
• Legio — для перебора продуктов реакции

В результате сотрудничества с командой KNIME эта открытая платформа для анализа данных, построенная на базе Eclipse, приобрела расширения для работы с химическими структурами, сделанные на базе Indigo.

Все продукты распространяются на условиях GPLv3 аутсорсинговой компанией GGA Software Services. Офис по разработке находится в Санкт-Петербурге. На сайте компании доступны сборки библиотек и утилит для Linux, Windows и Mac OS X.

>>> Подробности (ggasoftware.com)

До версии 2.0 обновился открытый фреймворк Tornado (Python), включающий масштабируемый и неблокирующий веб-сервер и сопутствующие приложения, используемый, в частности, для работы FriendFeed. Проект Tornado во много схож с воплощающими аналогичную функциональность web.py и Google WebApp, однако включает в себя дополнительные инструменты и оптимизацию для реализации неблокирующей системы. К тому же, по сравнению с конкурентами Tornado весьма быстр.

Изменения в новой версии включают поддержку Python 3.2, IPV6 для HTTPServer и HTTPClient, новые директивы шаблонов, использование реализации simple_httpclient для AsyncHTTPClient по умолчанию. Также изменены некоторые предустановленные настройки.

Скачать

>>> Подробности (google.com)

В статье описывается модуль myTkinter, существенно уменьшающий трудозатраты при создании оконных интерфейсов на Python на основе стандартного модуля Tkinter.

Значительно упрощается создание меню, формирование и упаковка окна. Набор поддерживаемых виджетов сравнительно невелик, но вполне достаточен для решения задач типа «быстро сделать простую форточку».

Кроме стандартных виджетов, предлагается несколько специализированных, в частности виджет myTree позволяющий на основе интроспекции отображать в виде дерева и редактировать произвольные питоновские данные.

Сам модуль доступен по ссылке http://a-iv.ru/pyart/src/myTkinter.py

>>> статья (a-iv.ru)

30 мая было объявлено о выходе PyDev 2.1.0 - плагина для Eclipse, предназначенного для разработки на Python, Jython и IronPython. Особенностью этого выпуска является отказ от поддержки Java 1.4 (необходима как минимум Java 5).

PyDev поддерживает функционал ожидаемый от современной IDE: автозавершение кода, подсветка синтаксиса, синтаксический анализ, рефакторинг, отладка и многое другое.

>>> Подробности (pydev.org)

26-го мая вышел корректирующий релиз Python 2.5.6 с исправлениями ошибок, связанных с безопасностью

• исправлена ошибка, позволяющая провести XSS-атаки в модуле SimpleHTTPServer
• В urllib и urllib2 добавлено игнорирование перенаправлений, если схема URL отлична от HTTP, HTTPS и FTP
• Решена проблема с расчётом длины строки в audioop
• в модуле audioop добавлены дополнительные проверки перенаправлений

>>> Подробности (python.org)

26 мая 2011 года после трёх дней успешного тестирования четвёртый релиз-кандидат был официально анонсирован как выпуск 4.7 (sagemath.org) открытой свободной среды для математических вычислений и визуализации их результатов - Sage.

Sage предоставляет пользователю основанный на Python интерфейс к 95-ти программным пакетам для математических расчётов, символьных вычислений, статистического анализа, программирования, сжатия и шифрования данных, построения графиков и многого другого.

Среди включенных в Sage пакетов широко известны и популярны: ATLAS, BLAS, Boost, bzip2, Cython, Docutils, ECL (sourceforge.net), f2c (netlib.org), FLINT, FreeType, G95 (g95.org), GAP (gap-system.org), Givaro, GLPK, GnuTLS, GSL (gnu.org), IPython, Jmol, jsMath, LAPACK, Libgcrypt, libiconv, libpng, M4RI, matplotlib, Maxima, Mercurial, MPFI, MPFR, MPIR, mpmath, NTL (shoup.net), NumPy, OpenCDK, PIL (pythonware.com), Pygments, Pynac, Python, R (r-project.org), SageNB, SciPy, Singular, SQLite, SymPy, zlib.

Sage был создан Вильямом Стейном (William Stein) в 2004–2005 годах с использованием Python, IPython, PARI, SWIG, Pyrex, NTL (shoup.net) и GMP (gmplib.org).
Используя наработки большого количества проектов с открытым исходным кодом лицензированных под GPL или GPL-совместимыми лицензиями, сегодня Sage распространяется под лицензией GNU GPLv2+ как в исходных кодах, так и в бинарных сборках для GNU/Linux, Solaris, Mac OS X и Windows.

Доступ к Sage можно получить через интерфейс «Notebook» в обыкновенном браузере благодаря SageNB (The Sage Notebook server) или в командной строке с использованием IPython.
Протестировать Sage можно на одном из специальных веб-серверов, адреса которых находятся на главной странице проекта.
В марте 2010 года такой сервер был запущен и в Украине (sage.openopt.org).

Со списком из более чем двухсот изменений можно ознакомиться в анонсе к выпуску.

Sage сопровождается подробной документацией, которую можно скачать или почитать он-лайн в разделе Documentation официального сайта.

>>> Исходный код

>>> Официальный сайт (sagemath.org)

Основные изменения:

• добавлен indicator applet (для оболочки Unity);
• добавлены комбинации клавиш для функций из главного меню;
• добавлены отсутствующие иконки в фильтре трекеров;
• добавлены колонки торрентов «Загруженные» и «Скачанные»;
• исправлено множество ошибок;

>>> Подробности (deluge-torrent.org)

14 мая 2011 года стала доступной для загрузки стабильная версия 1.6.0 расширения языка Python для научных вычислений - NumPy.

NumPy содержит функции для операций с многомерными массивами и матрицами, а также стандартные функции линейной алгебры, преобразования Фурье, генераторы случайных чисел и инструменты для интеграции C/C++ и Fortran кода.

NumPy был разработан на базе кода двух пакетов для Python: Numeric и Numarray и является неотъемлемой базовой частью проекта SciPy - набора библиотек для вычислений в прикладной математике и науке на языке Python.

Работа над Numeric и Numarray прекратилась в 2005 и 2006 годах соответственно, и теперь NumPy рекомендуется для их замены.

Вычислительная сила NumPy заключается в интерпретации большинства вычислительных алгоритмов в операции над массивами и матрицами, что уменьшает проигрыш NumPy в быстродействии компилируемым языкам, таким как C или Fortran.
Этим NumPy очень напоминает интерпретируемый язык MATLAB'a и потому считается одной из его перспективных альтернатив, конечно, в комплекте со специализированными пакетами для Python, такими как вышеупомянутый SciPy, matplotlib, GMPY и другими.

Функции линейной алгебры в NumPy основаны на коде библиотеки LAPACK.

NumPy 1.6.0 совместим и с Python 2.4 - 2.7, и с Python 3.1 - 3.2.
Среди основных изменений в этом выпуске:

• новый итератор, увеличивающий быстродействие большого количества функций
• добавление поддержки 16-битного формата чисел с плавающей точкой половинной точности - IEEE 754-2008 binary16 (half precision), как тип данных numpy.half
• добавлены полиномы Лежандра (Legendre), Лягерра (Laguerre), Эрмита (Hermite)
• поддержка генератором F2py (Fortran to Python) массивов с динамическими размерами (assumed shape arrays) по стандарту Fortran 90
• дополнения в C API
• добавление ряда новых функций и замена части старых

С полным списком изменений можно ознакомиться в архиве с исходными кодами или на странице загрузки на sourceforge.net.

Numpy распространяется под лицензией BSD (freebsd.org).
Кроме исходных кодов предоставляются также бинарные сборки для ОС Windows и Mac OS X.

>>> Исходный код NumPy

>>> Краткий список изменений

>>> Веб-страница NumPy (scipy.org)

Несомненно, заложенная в архитектуру языка Perl гибкость привела к естественному накоплению кода, который технически работает, однако очень хрупок при изменениях и труден для понимания. Проблема может усложняться тем, что авторы кода уже недоступны, так как перешли на работу в другой отдел или компанию. Помимо этого, требования к вашему продукту могли поменяться, либо оказалось, что новая версия используемого вами API доступна только на Python. В этот момент начинается эпохальная работа по переносу кода Perl на Python. В данной статье вы познакомитесь с некоторыми теоретическими аспектами работы с унаследованным кодом, в том числе узнаете, чего делать не стоит.

>>> Подробности (ibm.com)

30 апреля было объявлено о выходе новой версии PyPy — интерпретатора Python, написанного в основном на чистом Python и специальном подмножестве языка Python: Rpython. Имеет в своём составе поддержку stackless-режима и JIT-компиляции. К тому же PyPy можно рассматривать как экспериментальную площадку развития Python, так как новые возможности языка реализуются в нём быстрее и легче.

Изменения новой версии:

• Новый выпуск включает в себя возможности Python 2.6 и 2.7.
• Добавлена новая оптимизация JIT компилятора: теперь он может определять какие участки кода можно выносить за пределы цикла, не нарушая семантику тела цикла.
• Расширена поддержка API для C-расширений CPython. Это даёт возможность использования IDLE и Tkitner вместе с PyPy.
• cProfiler теперь может работать с JIT.
• Выполнен форк RPython, где реализована поддержка PostgreSQL.
• Разработчики проекта перевели документацию на систему Sphinx.
• PyPy успешно проходит стандартный тестовый пакет Python и поддерживает большинство из стандартных Python-модулей и фреймворков, таких как ctypes, django (с sqlite), twisted (без поддержки ssl), pylons, pyglet. PyPy может быть использован для бесшовной замены CPython 2.6 и CPython 2.7.

По сравнению с версией 1.4 скорость возросла в среднем на 25%.

>>> Подробности (morepypy.blogspot.com)

DevConf 2011 http://devconf.ru/ - профессиональная конференция, посвященная ведущим технологиям программирования и веб-разработки. В 2010 она собрала более 1200 веб-разработчиков http://2010.devconf.ru/

Участникам DevConf предоставляется уникальная возможность - получить доступ сразу ко всем лидирующим технологиям веб-разработки, послушав доклады от основателей этих технологий, приехавших в Москву со всего мира.

В рамках DevConf 4 июня 2011(суббота!) года пройдут 5 конференций:

• DevConf::PYTHON()
• DevConf::RUBY()
• DevConf::PHP()
• DevConf::PERL()
• DevConf::ASP.NET()

Формат конференции DevConf предусматривает первый конференционный день и второй день (5 июня) мастер-классов. Второй день является опциональным и требует отдельной регистрации.

Для кого DevConf?

Конференция нацелена на профессиональных веб-разработчиков и тех, кто мечтает ими стать. Она объединяет ВСЕ самые распространенные языки, при этом каждому выделен свой поток(зал).

Можно будет погрузиться именно в ту технологию, которая вызывает наибольший интерес. При этом уровень любого из направлений является максимально профессиональным. В каждой секции будут представлены доклады 1-2 непосредственных авторов языка, а также признанных экспертов в области.

Кто докладчики DevConf?

Для организации каждого из направлений мы привлекаем сообщества того или иного языка/технологии. Они приглашают признанных экспертов как российского, так и международного уровня.

Кто проводит DevConf?

DevConf является результатом деятельности огромного количества профессионалов.

В организации каждого потока принимают участие уважаемые в соответствующем сообществе люди.

Приглашаем докладчиков в основные потоки, а также на мастер-классы.

Мы открыты к сотрудничеству и будем рады обсудить любые способы взаимодействия с информационными, техническими и другими партнерами - 2011@devconf.ru

>>> Подробности (devconf.ru)

Тихо и незаметно вышла очередная версия программы управления сетью NOC.

Network Operation Centers (NOC) - динамично развивающая программа «Центра Управления Сетью». Написан на Python, использует Django каркас для веб приложений и базу PostgreSQL.

Изменения:

• Расширена поддержка оборудования: HP ProCurve9xxx, Huawei VRP, Juniper JUNOS, OS FreeBSD, Zyxel ZyNOS...
• Добавлен новый протокол обнаружения топологии сети: Foundry Discovery Protocol (FDP)
• telnet и ssh2 клиенты теперь полностью на Питоне.
• Поддержка Cisco Catalyst cluster.
• и множество других исправлений и улучшений касающиеся производительности, стабильности и удобства использования системы в целом...

Краткое описание функциональных возможностей.

Загрузить...

ебилды, Инит скрипт для Gentoo...

>>> NOC-0.6.3 (nocproject.org)

Приглашаем WEB-разработчиков к участию в 10-й Международной конференции DEVCONF::PHPCONF 21-22 мая 2011!

В программе конференции следующие интересные выступления:

День первый (21-го):

• Marcus Bourgerus (Google) с докладом «Introduction to pure functional PHP»
  
• Perl & Silverlight: новая альтернатива для создания Rich Internet Applications
  
• Сотрудничество Microsoft & Zend - PHP: DOTNET
  
• Perl и Web 2.0
  
• Moose - постмодернистская объектная система на Perl
  
• Пора отправлять С на свалку истории! Пишем демонов на PHP с использованием расширения libevent.(Вадим Крючков)
  
• PHP6: - Optimization is a Mistake от автора PHP. (Ilya Alshanetskiy - Core PHP Developer)
  
• рефакторинг Perl-кода
  
• Здоровая альтернатива MySQL - MariaDB. Один из авторов MySQL & MariaDB.(Michael Widenius, один из основателей MySQL AB, автор MySQL Server и MariaDB (http://monty-says.blogspot.com/).
  
• PostgreSQL 9.0 Final. (Голубь Павел, MicroOLAP Technologies Ltd Inc.)
  
• Флипчарт: PostgreSQL на DEVConf - встреча фанатов.(Алексей Тимохин)
  

День второй (22-го):

• PHP 6: Что нового в языке: полная поддержка Unicode, замыкания,лямбда и прочие улучшения.
  
• Опыт создания и эксплуатации высоконагруженных веб-проектов. Вопросы интеграции с 1С.
  
• построение совместимых Perl/mod_perl систем с последовательным интерфейсом
  
• разработка CMS для крупного портала
  
• Авторы PHP откроют секреты PHP (Exposing Hidden PHP Secrets / How PHP Ticks) (Derick Rethans)
  
• XML Sapiens как универсальная концепция сайтостроения в разрезе XML/PHP
  
• применение ORM в Perl
  
• ООП. Parrot. Можно закапывать.
  
• использование шаблона проектирования MVC в web-проектах
  
• использование web-based real-time графического вывода с использованием Perl
  

Мастер-классы 3дня, 2 потока:

• Практика независимой WEB-разработки (freelance)
  
• Практика разработки корпоративных веб-приложений 2011
  
• Экстремальное программирование: Agile Scrum по GTD к TDD - 2 дня (компьютерный класс)
  
• Организация Build-Test-Deploy цикла при разработке PHP приложений
  
• Как заработать деньги на Open Source
  
• Свой проект свободно распространяемого Программного Обеспечения
  
• Использование низкоуровневых возможностей PHP в разработке веб-приложений
  
• Практика использования технологии XSLT в приложениях php5
  
• XML в PHP6
  
• Разработка современной CMS
  
• Аргументы против XSLT
  
• Индексы MySQL - как использовать
  
• Платежные системы: основа - PHP
  

Формат участия
21-25 мая: конференция + мастер-классы (5 дней) или 21-22 мая: конференция (2 дня)

Желающие дать мастер-класс еще могут успеть подать заявку. Не забудьте встать в очередь за регистрацией

>>> Подробности (devconf.ru)

OpenERP запустила онлайн библиотеку с более чем 1000 свободных приложений для автоматизации управления и учёта предприятий.

Все приложения с открытым исходным кодом и охватывают различные области, такие как:

• управление взаимодействием с клиентами;
• бухгалтерский учёт;
• управление проектами;
• приложения, связанные с конкретными секторами (управление гостиницами, аукционными домами, учебными центрами, книжными магазинами, обрабатывающей промышленностью и другие).

Приложения разрабатываются совместными усилиями партнеров OpenERP, клиентами и членами сообщества. Разработка организована на Launchpad от Canonical, лучшие приложения сертифицируются и поддерживаются OpenERP SA (wikipedia.org).

Библиотека приложений

>>> Подробности (openerp.com)

После долгих месяцев разработки в свет наконец вышла новая версия этого довольно популярного веб-фреймворка, написанного на Python.

В первую очередь стоит отметить то, что 1.3 — это последняя версия фреймворка, которая будет поддерживать Python 2.4. Уже с версии 1.4 наличие в системе Python 2.5 будет обязательным условием.

Основные нововведения:

• основанные на классе представления (view);
• встроенная поддержка средств Python для ведения логов;
• встроенная поддержка для более простого управления статичным содержимым сайта;
• платформа для тестирования Django теперь поддерживает библиотеку unittest2;
• улучшения в поддержке перевода: контекстные маркеры и комментарии у строковых ресурсов.

>>> Подробности (djangoproject.com)

После полутора лет разработки (последняя версия была выпущена 9 сентября 2009 года) вышла в свет новая версия Jython — реализации языка Python на Java. Jython является интерпретатором и компилятором (с возможностью компилировать в байткод Java).

Помимо стандартной библиотеки, программы, выполняемые в среде Jython, могут использовать любые классы Java.

Список нововведений:

• модуль сокетов теперь поддерживает IPv6;
• модуль сокетов также поддерживает многоязычные доменные имена (Internationalized Domain Names (RFC 3490)), поддерживаемые в Java 6;
• повышение производительности: на тесте Richards Jython 2.5.2 работает в 3 раза быстрее, на тесте Pystone на 20% быстрее, чем версия 2.5.1;
• модуль Posix/nt был переписан, его производительность заметно улучшилась;
• улучшены сообщения OSError об ошибках в Windows;
• немного уменьшено время запуска;
• улучшен модуль эмуляции readline (требуется для поддержки IPython);
• функции Python теперь могут быть переданы непосредственно в методы Java, которые принимают одиночный метод интерфейса (например, Callable или Runnable);
• добавлен индексатор Google;
• исправлены многочисленные ошибки.

>>> Подробности (jython.org)

Netsukuku — это проект по созданию самоорганизующейся сети с независимыми от интернета каналами передачи данных.

Главные особенности проекта — фрактальные алгоритмы построения карты сети и маршрутизации, и система доменных имен ANDNA (Abnormal Domain Name Anarchy).

В настоящее время в проекте один активный разработчик. Недавно он довёл проект до рабочего состояния и запустил свою тестовую netsukuku-сеть, а также добавил возможность подключённым к интернету узлам раздавать соединения узлам, которые к интернету не подключены.

Напомню, проект однажды перешёл c C на Python и до недавнего времени был в нерабочем состоянии.

>>> Подробности (pyntk.blogspot.com)

Foobnix — это новый музыкальный плеер с возможностью прослушивания музыки как локально, так и с интернета.

Отличительные особенности:

• поддержка форматов без потери качества, различных CUE, wv, iso.wv;
• поиск музыки онлайн и моментальное прослушивание по исполнителю и жанру (интеграция с last.fm + vkontakte);
• поиск и просмотр видео;
• интегрированы различные сервисы last.fm;
• более 3000 радиостанций в комплекте;
• навигация и поиск по дереву музыки;
• плейлисты в табах.

Список изменений:

• добавлен простой редактор тегов с возможностью пакетной обработки тегов для группы файлов;
• улучшена интеграция с last.fm (любимые треки, top-артисты, top-треки, биография);
• всплывающие сообщения о проигрываемой композиции (опционально);
• автоматическое скачивание онлайн-музыки;
• редактирование названий и удаление файлов/каталогов прямо из плеера;
• новые кнопки для включения случайного проигрывания и очередности;
• поддержка открытия содержимого директории в файловом менеджере (настраивается);
• улучшен регулятор громкости;
• ускорен и переделан поиск онлайн-музыки;
• оптимизирован интерфейс drag&drop;
• обеспечено кэширование информации, загруженной из сети: обложек дисков, названий альбомов, текстов песен;
• отображение технической информации о проигрываемом файле, а также о состоянии плеера в статус-панели;
• возможность копирования списка композиций в формате, удобном для выкладывания на трекере;
• увеличение быстродействия плеера (более быстрый старт, выход и некоторые другие функции).

>>> Подробности (foobnix.com)

20 февраля вышел Python 3.2.

Так как действует «Мораторий на измение языка» (PEP-3003), то синтаксис языка остался прежним; было внесено всего несколько изменений во встроенные типы.

Усилия разработчиков были сконцентрированы на стандартной библиотеке и поддержке портирования кода на Python3.

Среди изменений стоит отметить:

• множественные изменения в модуле unittest;
• PEP 3147, поддержка PYC Repository Directories;
• PEP 3149, поддержка контроля версий динамически-подключаемых библиотек;
• PEP 3148, futures — новая библиотека для асинхронных вычислений (конкурентного программирования);
• PEP 384, стабильное ABI для модулей расширений;
• значительно переделан GIL (Global Interpreter Lock);
• расширенный пакет email, который поддерживает байтовые сообщения;
• значительно улучшен модуль ssl;
• новый модуль sysconfig;
• улучшения модуля shutil, среди которых стоит отметить поддержку архивов;
• множество улучшений в configparser;
• улучшен pdb (Python debugger);
• множественные исправления, связанные с ошибками bytes/string;
• множественные исправления для численных операций.

>>> Подробности (python.org)

Вышла новая книга серии Библиотека ALT Linux.
Это учебно-методический комплекс «Практикум по алгоритмизации и программированию на Python», который предназначен для начального знакомства с основными алгоритмами и с программированием на языке Python в интегрированных средах разработки (IDE) Geany и Eric. Автор книги Хахаев И.А.

Комплекс состоит из учебного пособия, в котором рассматриваются типовые задачи в рамках базового курса информатики для средней школы (с учётом требований ЕГЭ), алгоритмы их решения и реализация этих алгоритмов на языке Python и методических указаний для учителей, где описываются особенности IDE Geany и IDE Eric, а также причины и особенности обучения программированию на Python. Кроме того, комплекс дополняется примерами программ по каждому разделу учебного пособия (32 файла с примерами вариантов разобранных задач.).

Там, где это возможно, приводится универсальное решение, которое с минимальными исправлениями может быть реализовано на других языках программирования высокого уровня и параллельно даётся решение с использованием специфики языка Python.

Дополнительно в пособии описываются основы моделирования и программирования графики в Python с использованием модуля turtle и кросс-платформенной библиотеки Tkinter.

Приобрести книгу можно в интернет-магазине AltLinux или бесплатно скачать с сайта.

>>> Подробности (altlinux.ru)