LINUX.ORG.RU

Выпущен UGENE 1.7

 , ,


0

0

UGENE — это свободное ПО для работы молекулярного биолога, написанное на Qt.

Данный продукт во многом является аналогом (а местами и гораздо более функционален) коммерческого пакета Vector NTI, однако отличается кроссплатформенностью, поддержкой возможностей современного железа (многопоточность, CUDA) и возможностью самому писать плагины либо мышекликабельно создавать вычислительные цепочки из плагинов уже существующих.

Описание программы: http://ugene.unipro.ru/rus/index.html

>>> Скачать

★★☆☆☆

Проверено: annoynimous ()

там можно ДНК новые создавать?)

Deleted ()

интересный пакет. А в нем можно красить множественное выравнивание по собственному усмотрению ? группы и цвета задавать. На скриншоте картинка с 3д визуализацией, оно реально умеет ? сравнимо с pymol или только примитив ?

silw ★★★★★ ()

Ух ты, спасибо за информацию. Попробую скормить жене.

AlexM ★★★★★ ()
Ответ на: комментарий от pekmop1024

Мир в генту собирают уже давно :)

anonymous ()

Ладно, IDE есть, терерь нужен компилятор.

anonymous ()

Улыбнуло: 3 скриншота - 3 операционки.

Выглядит не вырви глаз (хоть и совсем не понимаю, что же там такое).

Разработчикам: «МОЛОДЦА»

AlexVR ★★★★★ ()
Ответ на: комментарий от silw

>А в нем можно красить множественное выравнивание по собственному усмотрению ?

Хз, видел только разные цветовые схемы. По идее можно реквестировать на форуме разработчиков. ПО моему запросу поддержку прокси с авториазцией добавили

картинка с 3д визуализацией, оно реально умеет ?


Умеет

сравнимо с pymol или только примитив ?


Хз, pdb открывает, кривые pdb не открывает. Генбанковские файлики открывает, стиль отображения как в генбанке. Огромным преимуществом является возможность выделения аминокислот на строке последовательности а не на 3д-модели

DNA_Seq ★★☆☆☆ ()

Походу, в разработке использовался Qt. Это радует. То, что это отечественная разработка, радует вдвойне.

А не радует страница видеороликов. Свою науку развивать не хотим чтоли? Создадим искусственно языковый барьер, и будем пыжиться на рунглише рассказывать о программе, наплевав на отечественную науку? Я смысла такого действия этого не понимаю.

xintrea ()

>ПО для работы молекулярного биолога

Что за чурка нерусская писала?

написанное на Qt

А на gcc оно не написано? А на gdb?

Пишите по-русски.

derrix ()
Ответ на: комментарий от derrix

Ты выпендриваешься. Qt - диалект плюсов, транслируемый их собственным компилятором в C++. Так что «написанное на Qt» вполне закономерно.

KblCb ★★★★★ ()
Ответ на: комментарий от KblCb

>Qt - диалект плюсов

Да ты шо! Сам придумал? Нет такого языка «Qt». Qt такой же диалект C++, как C++ диалект C.

derrix ()
Ответ на: комментарий от xintrea

>наплевав на отечественную науку

А ещё они на людях без ручного медведя показываются, просто вопиющее неуважение к России.

anonymous ()
Ответ на: комментарий от derrix

Безусловно. Вот только код на Qt не компилируется плюсовыми компиляторами, а на C++ - сишными. А так, да. Все языки - подмножество лиспа.

KblCb ★★★★★ ()
Ответ на: комментарий от xintrea

Наверное потому, что в россии не такая большая целевая аудитория ? Тем более контакты есть, что мешает связаться с авторами и реквестировать необходимую информацию на русском ? Научная братия, как правило, весьма дружелюбно относится к подобным просьбам.

silw ★★★★★ ()
Ответ на: комментарий от xintrea

Вот не думаю, что рассказ на русском языке от русских программистов даст толчок биологии в стране. Сейчас же есть шанс привлечь пользователей из разных стран. И уж всяко лучше снять 2 ролика для всех пользователей, чем один и тот же - но с выделенной версией для русскоязычных пользователей.

OleGG_LieAngel ()
Ответ на: комментарий от silw

Ага, можно. Пару модулей уже по просьбам из института цитологии и генетики написали.

OleGG_LieAngel ()
Ответ на: комментарий от KblCb

Бросай курить, а то такой бред несёшь...

anonymous ()
Ответ на: комментарий от AlexM

Только сейчас обратил внимание, что её двумя этажами ниже пишут :)

«Надо чаще встречаться» и «ЛОР объединяет» :)

AlexM ★★★★★ ()
Ответ на: комментарий от OleGG_LieAngel

Ну, если оно пойдёт в работе, то можно будет сделать рассказ от имени русских биологов :) Молекулярных биологов :)

AlexM ★★★★★ ()

А реалистичные видеоэффекты и встроенный тетрис в окне «О программе» это то, без чего ни одна программа для биолога обойтись не может?

zenden ()
Ответ на: комментарий от zenden

> А реалистичные видеоэффекты и встроенный тетрис в окне «О программе» это то, без чего ни одна программа для биолога обойтись не может?

Это вы сейчас к чему написали?

iefremov ()
Ответ на: комментарий от derrix

а чего прискребся, нормально написано, или ты не знаешь что такое QT, если так уже смотреть вглубь все в машиных кодах в итоге...

grigoreo ()
Ответ на: комментарий от zenden

>А реалистичные видеоэффекты и встроенный тетрис в окне «О программе» это то, без чего ни одна программа для биолога обойтись не может?

Ну так допустим пока сиквенс собирается, контиги выравниваются сидишь и играешь в тетрис. Жаль сапера нет и пасьянса «паук»

DNA_Seq ★★☆☆☆ ()
Ответ на: комментарий от OleGG_LieAngel

Но субтитры точно бы не помешали. Хотя изготовление субтитров думаю займет столько же времени сколько озвучка

DNA_Seq ★★☆☆☆ ()
Ответ на: комментарий от xintrea

>Свою науку развивать не хотим чтоли? Создадим искусственно языковый барьер, и будем пыжиться на рунглише рассказывать о программе, наплевав на отечественную науку? Я смысла такого действия этого не понимаю.

В молбиологии засилье английского еще больше, чем в IT. Если помните, лысенковцы дольше продержались, чем обличители буржуазных компьютеров.

Linfan ★★★★★ ()
Ответ на: комментарий от silw

>Наверное потому, что в россии не такая большая целевая аудитория ?

Не то слово! ЭксСССР в плане молбиологии - практически Буркина-Фасо. В универах ничему не учат, все, что можно освоить - все из западных источников. Академические институты практически поголовно коммерциализировались и штампуют всякий медицинский ширпотреб.

Linfan ★★★★★ ()
Ответ на: комментарий от DNA_Seq

Вместо прямого наложения субтитров в роликах наиболее важные места помечаются аннотациями. Это некоторым образом нагляднее.

iefremov ()
Вы не можете добавлять комментарии в эту тему. Тема перемещена в архив.