LINUX.ORG.RU

Новый Avogadro

 ,


0

1

Что порадовало в новом Avogadro- — можно сразу рисовать нужные атомы, не извращаясь с заменой через Просмотр-Настройки-Свойства атомов (Ansicht - Einstellungen - Atom-Eigenscheften). Даже менюшку удобную для выбора атомов любого элемента таблицы Менделеева сделали. Другие возможности тоже впечатляют, но эта была особо долгожданной.

Одно немного напрягает: по умолчанию в оптимизации посредством силового поля оставили оптимизацию через MMFF94, но сделали предупреждение всплывающие, типа «рекомендуем использовать UFF для оптимизации структур молекул». Сменили б тогда на UFF по умолчанию, чего уж. Немного напрягает это предупреждение при использовании не UFF для оптимизации.

На скрине изображена молекула триэтилбора.

>>> Просмотр (1366x768, 139 Kb)

★★

Проверено: JB ()

Что порадовало в новом Avogadro...

сентябрь 2012???

firsttimeuser ★★★★★ ()

Почему тэг «chemie» на немецком вместо «химия» или на худой конец «chemistry»?

Loki29 ★★ ()
Ответ на: комментарий от Loki29

Если на то пошло, почему вообще весь интерфейс на немецком? Автор язык изучает, что ли.

robert_foster ★★ ()

А что надо сделать, чтобы он оптимизировал геометрию? Попробовал нарисовать пробную молекулу (гликольурил), и потыкал оптимизацию геометрии. На любой вариант пишет, что не может выбрать силовое поле для молекулы.

ogion ★★ ()
Ответ на: комментарий от OldWiseCat

В генте сабж долго не обновлялся вроде. Или я пропустил чего?

Dorif ★★ ()
Ответ на: комментарий от Dorif

Aber Deutsche woerter sind nicht wichtig, wenn Sie am Russische Forum kommunizieren. Das ist meine Meinung.

Loki29 ★★ ()
Ответ на: комментарий от Loki29

Und Sie können in Englisch auf dem russischen(russisch ist Adjektiv, kein Substantiv) Forum sprechen, nicht wahr?) Und ich werde Sprache des Systems ändern nicht zum Wohle der Screenshot im Forum.

Dorif ★★ ()
Последнее исправление: Dorif (всего исправлений: 1)

Классная штука, прикольно дёргать молекулы когда они считаются в реальном времени.

Dron ★★★★★ ()
Ответ на: комментарий от ogion

А валентности нигде не напутал? И какая версия Авогадро и что используешь для оптимизации(UFF, MMFF94...)? MMFF94 не для всех элементов умеет оптимизировать, например.

Dorif ★★ ()
Последнее исправление: Dorif (всего исправлений: 1)
Ответ на: комментарий от Dorif

Ich stimme Dir voll zu. Es würde sicherlich keinen Sinn machen. Ausserdem finde ich eine Benutzeroberfläche in deutscher Sprache ganz in Ordnung. Wenn jemand meckern will, findet immer einen Grund.

rha ()

Всё-таки данный тип рисования упоротым получается, добавление бензольного кольца или другого фрагмента крайне неудобным получается, на попытке с трудом нарисованный ЖК оптимизировать оно навернулось.

Оживил бы кто-нибудь развитие ghemical, более удобного рисования пока не попадалось.

dn2010 ★★★★★ ()
Ответ на: комментарий от LongLiveUbuntu

Неа, откатился обратно на гентушку.) А если чего для убунты собрать понадобится - виртуальные машины всегда под рукой.)

Dorif ★★ ()
Ответ на: комментарий от vurdalak

OMG, он вернулся!

долгая история, и ко всему уже боянистая

q11q11 ★★★★★ ()
Ответ на: комментарий от Dorif

Cмысл? все равно 95% документации на английском и ломаном английском, остальное на китайском и прочих мунспиках.

AiFiLTr0 ★★★★★ ()
Ответ на: комментарий от AiFiLTr0

Не для химии. Я в первую очередь химик. Органик-синтетик. А по этой отрасли на немецком дохрена и трошки. Причём непереведённого.

Dorif ★★ ()
Ответ на: комментарий от Dorif

А валентности нигде не напутал?

А что там можно напутать? https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/c/c6/Glycoluril.svg

Нарисовал встроенными средствами, попробовал пооптимизировать, и ничего не получилось.

И какая версия Авогадро и что используешь для оптимизации(UFF, MMFF94...)? MMFF94 не для всех элементов умеет оптимизировать, например.

Версия 1.1.0. Пробовал все варианты подряд (UFF, GAFF, Ghemical, MMFF94, MMFF94s), результат везде был одинаковый.

ogion ★★ ()
Вы не можете добавлять комментарии в эту тему. Тема перемещена в архив.