Думаю, все посетители этого сайта представляют себе, что такое операционная система компьютера, его программное обеспечение и как оно взаимодействует с железом, хотя бы вот в таких общих чертах:
BIOS инициализирует железо и запускает код, который уже загружает в оперативную память загрузчик, который загружает ядро ОС и всё необходимое для его старта.
В итоге, после завершения загрузки, в оперативной памяти компьютера имеется определенный код, который может подгружать что-то с внешних носителей, управлять железом, взаимодействовать со внешним миром и, в частности, пользователем.
Вот именно это — то что находится в оперативной памяти — это и можно (и наиболее естественно) считать душой компьютера. С человеком наблюдается полная аналогия — разве что архитектура его процессора (мозга) немного другая — и часть памяти находится в структуре связей нейронов. Принципиально мозг человека и машина Тьюринга эквивалентны, хотя мозг и может работать намного быстрей за счёт высокого параллелизма. Впрочем, современные компьютеры идут в ту же сторону — наращивают число ядер.
Таким образом, душа человека — это не что-то сверхестественное и непознаваемое, а аналог компьютерной ОС, имеющий ту же природу — нематериальную, но естественную — информационную.
И используя эту концепцию можно уже думать дальше над такими вопросами, как возможность или невозможность загробной жизни, реинкарнации и их свойств. Всё что обычно считается прерогативой религии — может изучаться научными методами. Тем более что у нас уже есть отличная модель человеческого тела и души— компьютер и его ОС.