LINUX.ORG.RU
ФорумTalks

[биологам] Чего вам не хватает?


0

0

Хочется сделать что-нибудь доброе, светлое, вечное, так что решил начать свой open source проект. Идея не оригинальная, понимаю, но тем не менее. Не смотря на то, что заканчивал я «Прикладную математику», биологию люблю со школы, читал какие-то книжки, статьи, так что представляю собой самый страшный вид дилетанта - дилетант, думающий, что что-то знает :) Собственно, идея сделать что-нибудь нужное и, заодно, почитать умные книжки. Так что, господа биологи, колитесь, чего вам не хватает.

P.S. Рассматриваю так же вариант присоединиться к уже существующему проекту, если подскажете подходящий.

★★★★

Ответ на: комментарий от Somewho

>я тоже

А, ну тогда ясно) У нас это профессиональное.

Вот жеж нищеброды - задроты!


Сам такой.

Zhbert ★★★★★ ()

Чего не хватает, сказать сложно. В каждой области свои узкоспецифичные приложения.

Кстати, раз уж зашла речь, не могу не поделиться - есть у нас в лабе приборчик.. ну и прога к нему, которая покозания снимает. Прога написана институтом приборостроения. Нашим! И ну так вот - ученые знаете как ее графики сохраняют? - принтскрином!!! - это ппц просто!!!

Так можешь попробовать определитель растений написать. А то чаще это толстенная книга, по которой надо рыскать следуя инструкции - по сути та же программа.

Еще хорошо бы моделирование. 3D модели, например, работы каких-либо молекулярных механизмов.

hibou ★★★★★ ()

Что-то все кинулись оси писать/прожекты делать. Обострение

dragonfly ()

На самом деле даже в области таких простых штук, как alignment editor разброд и шатания.

А уж написать хорошую FOSS молекулярно-биологическую IDE — это сложно и очень интересно.

Проблема в том, что всё это нужно потом как-то поддерживать.

Davidov ★★★★ ()
Ответ на: комментарий от hibou

> Еще хорошо бы моделирование. 3D модели, например, работы каких-либо молекулярных механизмов.
Есть древняя мечта. Программа, в каком-то смысле аналог Гугловской Земли - но про человеческое тело. Понятное дело, с возможностью проникать вглубь на произвольную глубину и с произвольным увеличением.

Нужны как минимум два варианта - мужское и женское тело.

svu ★★★★★ ()
Ответ на: комментарий от svu

>Нужны как минимум два варианта - мужское и женское тело.

Чтобы особо стукнутые извращены проникали виртуально =)

Хотя идея хорошая, такое можно сделать. Только для этого надо трезмерные сцены ваять, модельки органов делать и т.д. Но сделатьм можно.

Zhbert ★★★★★ ()
Ответ на: комментарий от svu

>Разумеется, с отсылками на педивикию и другие (адекватные) источники по физиологии

Проникаешь себе, проникаешь туда-сюда в половой орган женщины, наконец проник до конца...а там ссылка на педивикию.

Zhbert ★★★★★ ()
Ответ на: комментарий от svu

>Нужны как минимум два варианта - мужское и женское тело.


0_o Хренасе фантазии. Я тоже хочу женского варианта.

ansi ★★★★ ()
Ответ на: комментарий от Zhbert

Да, там очень нехилая работа по созданию контента. Но тем большая ответственность на разработчиках движка - максимально облегчить ввод информации.

Развивая мысль дальше... Можно позволить проводить операции - ну как флайт-симулятор, но для хирургов :) Можно пытаться ввести возможность отслеживать обмен веществ - типа, когда ты сожрал кусочек шашлыка и запил красненьким (и закурил трубочку), куда и с какой скоростью оно все потекло... Да мало ль интересного в нашем организме происходит.

svu ★★★★★ ()
Ответ на: комментарий от svu

>Разумеется, с отсылками на педивикию и другие (адекватные) источники по физиологии

Это можно как аддон, по дефолту офф.

ansi ★★★★ ()
Ответ на: комментарий от ansi

Кстати, процесс моделирования зачатия, вынашивания и родов - тоже вполне полезная вещь. Можно использовать на курсах подготовки будущих мам.

Короче, применений куча. Но и объем работы аццкий, если делать максимально гибкую систему.

svu ★★★★★ ()
Ответ на: комментарий от ansi

Ну в гуглоземле это все включается-отключается, так и тут.

svu ★★★★★ ()
Ответ на: комментарий от svu

>Кстати, процесс моделирования зачатия .... Можно использовать на курсах подготовки будущих мам.

И пап!

ansi ★★★★ ()
Ответ на: комментарий от svu

>Но и объем работы аццкий, если делать максимально гибкую систему.

Я бы взялся кодить. Ну если б нас собралось таких человек 5-10 хотя б, не считая тех, кто модельки органов забабахает и т.д. Идея отличная, ИМХО.

Zhbert ★★★★★ ()
Ответ на: комментарий от ansi

Извините, конечно же, и пап тоже. Сам ходил...

svu ★★★★★ ()
Ответ на: комментарий от hibou

Просто клетка не так интересна ширнармассам ИМХО. Хотя объективно - согласен.

svu ★★★★★ ()
Ответ на: комментарий от Zhbert

Надо сначала найти достаточное кол-во медиков-биологов высокой квалификации, согласных регулярно выделять немалое время на заполнение контента.

svu ★★★★★ ()
Ответ на: комментарий от hibou

>И ну так вот - ученые знаете как ее графики сохраняют? - принтскрином!!! - это ппц просто!!!

После того, как увидел, что однокурсник экспортирует диаграммы из Dia принтскрином, меня подобные случаи не удивляют.

Причём после «экспорта» он в Paint'е сетку стирал.

srj ★★ ()
Ответ на: комментарий от Davidov

> На самом деле даже в области таких простых штук, как alignment editor разброд и шатания.

А уж написать хорошую FOSS молекулярно-биологическую IDE — это сложно и очень интересно.

А поподробнее можно? Не очень понял, что такое молекулярно-биологическая IDE, гугл тоже не спас. Или ссылку на пример хотя бы.

Gvidon ★★★★ ()
Ответ на: комментарий от svu

>Грабить корован посреди желудочно-кишечного тракта - это бесчеловечно.

Да глубоковато.

ansi ★★★★ ()
Ответ на: комментарий от dragonfly

Анатомические атласы никогда не видел? Я вот в свое время за ними просидел в читальном зале не один десяток часов.

Если делать, то нужно определиться какая глубина нужна. В смысле подробности.

hibou ★★★★★ ()
Ответ на: комментарий от svu

>Надо сначала найти достаточное кол-во медиков-биологов высокой квалификации, согласных регулярно выделять немалое время на заполнение контента.

Это тоже желательно, хотя можно для начала обойтись педивикией или другими ресурсами.

Zhbert ★★★★★ ()
Ответ на: комментарий от dragonfly

Вот это самое интересное - разработать архитектуру, общий принцип построения 3д модели. Она должна быть сильно масштабируемой (в идеале - до клеток, хотя бы локально в отдельных точках). И насчет пользовательского интерфейса - не так чтоб тривиально....

svu ★★★★★ ()
Ответ на: комментарий от hibou

> Так можешь попробовать определитель растений написать. А то чаще это толстенная книга, по которой надо рыскать следуя инструкции - по сути та же программа.

рисуешь навскидку лист и прога подбирает похожие по базе данных?

opensuse ()
Ответ на: комментарий от hibou

Вот-вот. Именно атлас, но интерактивный, 3Д. Глубина - как я сказал выше, чтобы была ВОЗМОЖНОСТЬ (не обязательно сразу в виде конкретного контента) добраться до клеток. Есть ведь интересные клетки типа нейронов, кровяных, глазных клеток, половых опять же (куда ж без них, особенно если моделировать процесс внутриутробного, с самого начала)...

svu ★★★★★ ()
Ответ на: комментарий от opensuse

>рисуешь навскидку лист и прога подбирает похожие по базе данных?

Фотку сунуть =)

Zhbert ★★★★★ ()
Ответ на: комментарий от opensuse

Нет. Так мало будет. В определителе не только параметры листа. Для начала можно просто вопросы пользователю позадавать. Как в бумажном определителе.

hibou ★★★★★ ()
Ответ на: комментарий от Zhbert

> Гугли, что такое IDE в общем
An integrated development environment (IDE) also known as integrated design environment or integrated debugging environment is a software application that provides comprehensive facilities to computer programmers for software development.

С точки зрения биологии так же был найден Insulin-degrading enzyme. Что-то мне подсказывает, что это не то

Gvidon ★★★★ ()
Ответ на: комментарий от dragonfly

Так есть же библиотеки, особенно для перла

DNA_Seq ★★☆☆☆ ()
Вы не можете добавлять комментарии в эту тему. Тема перемещена в архив.