Меня бесит:
1)В гноме если пытаться сделать Drug-n-drop из окна в окно то окна перекрываются (попробуйте из наутилуса перетащить в totem если окно totem над наутилусом)
2) Что freedesktop.org давно придумал папку .config, но все новые версии программ упрямо засерают ~/
3) Что некоторые пакеты даже в таком педантичном дистре как Debian все равно оставляют после себя даже бинарники (откуда-то у меня валяется /usr/bin/mozilla и не принадлежит ни одному пакету)
4) Нету HIG на вывод progname --help (некоторые Usage просто невозможно/неудобно читать), также -help тоже бывает хотя это имхо не правильно (нужно --)
5) КАКОГО дьявола у gnome-terminal всего 16 цветов в палитре? Да и в консоли черти что... в итоге color-themes у emacs невозможно поюзать.
Ну и меня просто трясет если после распаковки архива все файды вывалились прямо в текущий каталог (это наверное наследие виндузятничества)