Удаление программ

В FAQ.

Использовать checkinstall

> Скажите, пожалуйста, как удалять программы, установленные из исходников? Дистрибутив - Slackware. В pkgtool их не наблюдается. make uninstall тоже нет.

Попробуй собрать эту же программу с тем же prefix'ом, но уже с помощью checkinstall, потом поставь полученный пакет и сразу же удали. Криво, но должно помочь