Пропадают встроенные микрофон, динамики при подключении микрофона.

Для начала хорошо бы проверить через alsamixer, который часть пакета alsa-utils все ли включено в системе. Но скорее всего проблем не должно быть и через pavucontrol - панелька настроки для pipewire/pulseaudio серверов звука. Вообще в настройках можно приказать им выключаться и включаться только по вызову, так что искать откуда именно корни вряд ли получится, но можно глянуть из-под суперпользователя что пишет в логах красным su, пароль, dmesg или dmesg -l3 и dmesg-l4, или dmesg | grep error или dmesg | grep Error.

Я посмотрел через alsamixer. До подключение микрофона headphone стоит на 0<>0, а speaker 100<>100. После подключения наоборот: headphone 100<>100, speaker 0<>0. Я пытался после подключения speaker поднять, но звук не появлялся. А то что вы писали дальше, про суперпользователя, я к сожалению не понял.

Джек комбинированный? А как надо чтоб было? Чтобы звук всегда шел из динамиков? А записывался с какого устройства?

А понимать не надо, достаточно знать, как скопировать команды в терминал и выводы их него Как правильно копировать вывод терминала а мы подскажем, какими командами продиагностировать и решить проблему.

Я немного разобрался в alsamixer, оказывается по какой-то причине звук, идущий в динамики, мутился. Поэтому я просто его размутил клавишей m и прибавил громкость. Всё заработало.

Скорее всего система считала какой-нибудь HDMI выход местом куда надо выводить звук в первую очередь. Иногда в pavucontrol надо заставлять использовать профессиональный аудио и конкретное место указывать, но это есть звуковая карта от Creative последнего поколения с которой особые танцы с бубнами нужны как правило в линуксе. ALSA это ядерный уровень с драйверами и управлением отключением поэтому она на себя берет контроль, но если запущен Pipewire он глушит и ALSA и Jack/Jack2 и Pulseaudio будучи как бы заменой всему. И вот его то и надо настраивать если хочется более качественный звук. В цифровом виде уже даже ютуб начал выдавать нечто получше, поэтому хорошо бы поковыряться с настройками если это важно.