bsd в dom0 qubes

В теории - можно (гугли xen bsd dom0), но сделать это сможешь только ты сам. Официально поддерживается только федора https://www.qubes-os.org/doc/supported-versions/#dom0

Нет. Поддержка dom0 есть только в Net и Free. В Open есть только поддержка domU.