точное время по ntp

Грабли в неправильно выставленом часовом поясе

cat /etc/sysconfig/clock
ZONE="Europe/Kiev"
UTC="no"
ARC=false

что тут неправильно?

я конечто понимаю что System V4 ит пальцы веером
а есть у вас /etc/localtime и куда он кажет ?

/etc/localtime - бинарный файл который, проверял по md5 :)), соответствует файлу /usr/share/zoneinfo/Europe/Kiev

У меня одно время было подобное, правда не на 2 часа, а на 21 секунду. Сделал localtime символической ссылкой. Вроде глупость, но помогло.