В убунте - launchpad, его система PPA, багтрекера, переводов и т.д., объединенная в одно целое
У арча - aur и простая система сборки пакетов из исходников
В генте - use флаги, hardened профиль, ебилды
А чем кардинально выделяются другие дистрибутивы? Дефолтный набор программ и оформление не в счет