Сабж.
Поймал тут, что emerge dev-libs/boost чудовищно тормозит машину. Почти до завешивания на многие секунды. Мышка только катается, даже окошки не переключить...
Первая мысль была на счёт /var/tmp/portage. Но даже tmpfs ситуацию не спасло.
Вторая мысль - reiser4 в /usr.
Скорее всего что-то там от интенсивной работы не так со временем становится. На тестах такое не выявилось...
В раздумьях теперь...