Увидел сейчас свежий Raspbian с этим вашим Pixel'ем. Настройка переключения раскладки - ещё тот ребус. Особенно для рандомного юзера. Нагуглил это: http://life2.ru/2017/01/чиним-переключатель-клавиатуры-в-raspbian-jessie-with-p/ . Ага, щаз. Галочка «Сохранить системные раскладки» в том диалоге неактивна. А после правки конфига панели (только секции xkb) она вообще опустела напрочь.