в принципе проблем не должно быть если ипользуется более-менее стандартные проги. Не знаю как поведет со специфичными. Сам так уже 2 месяца назад перешел - не нарадуюсь.
стопудов все программы стабильны и чтобы ты с ними не дал не валятся. пытался написать программу, сваливающуюся в сегфолт - не получилось, ибо стабильно!
а если без шуток, то стабильность программ ничем не отличается от x86 (в лудшую сторону так уж точно) тот же код ведь. бывают косяки с размером указателя в программах (и прочая соответствующая х#ень), но таких уже к счастью мало.
а по поводу производительности: гигантского прироста в зависимости от режима работы (x86 или x86_64) нет. будем надеется что ситуация поменяется =) (http://www.opennet.ru/opennews/art.shtml?num=7388)
Собрать кросс-компилятор с host=i486-slackware-linux и target=x86_64-slackware-linux(к примеру), с кросс-тулчейном(glibc/binutils) и понемногу перекомпилировать под 64 бита все системные бинари и библиотеки, затем под 64 бита ядро, затем перегрузиться с этим 64-хбитным ядром в 64-хбитное(скомпилированное выше)окружение и продолжать докомпилять дальше.
Игра не стоит свеч. Если хочешь 64-хбитный дистрибутив - возьми порт слаки slamd64