Почему свободное дисковое пространство различно для обычного пользователя и для root-а?

обычному пользователю не везде можно совать свой нос с помощью du :)
т.е. дело в правах.

Не понял, простите. PS: Что такое права я знаю :). Как они влияют на свободное пространсво?

Может речь идет о 5% резерве на ext2/3 ?

$ df -h
Filesystem            Size  Used Avail Use% Mounted on
[skip]
/dev/sda2             3.9G  1.4G  2.4G  37% /
/dev/md0               59G   44G   13G  79% /home
[/skip]

 sudo tune2fs -l /dev/md0|grep Reserved
Reserved block count:     780401
Reserved blocks uid:      0 (user root)
Reserved blocks gid:      0 (group root)

$ sudo tune2fs -l /dev/sda2|grep Reserved
Reserved block count:     51584
Reserved blocks uid:      0 (user root)
Reserved blocks gid:      0 (group root)