Archlinux после обновления системы долго загружаются некоторые gtk приложения.

Таки гнев Патрика за оставление Слаки :)

Таки дельное что нить предложил.

А когда обновлялось, ставилось из бинарных реп?
Может попробовать из AUR'a всё обновить через
$ yaourt -Ss --aur thunar
$ yaourt -S --aur thunar(-svn/-cvs/-hg/-git)
$ yaourt -Ss --aur gkrellm
$ yaourt -S --aur gkrellm(-svn/-cvs/-hg/-git)

Дык просто pacman -Syu, обычно прокатывало без вопросов. Правда это было после смены current-->core.

Хм, у меня всё нормально и смена current-->core прошла на автомате, править руками пришлось минимально..
Вообще с месяц назад у меня почему то валились zsh и ktorrent (да, с темами KDE тоже была трабла..), ставлю их
$ pacman -S zsh
$ pacman -S ktorrent
некоторое время проходит (~ 2-3 дня) и валятся, zsh ругается при опознинии юзера/на недостаточность инициализации каких-то переменных/потом дошло до того, что просто тупо не принимает пароль user'a - только root и фсё..
ktorrent просто брал время из /dev/random и вылетал в сегфолт, а потом выдавал кипу ошибок при инициализации уже на половину скачанных торентов.
Короче сделал принудительную переустановку -
$ pacman -S zsh && pacman -S ktorrent
и всё прошло.. опять на 2-3 дня, а с выходом новых версии и последующим обновлением всё тип-топ - как и не было ничего, хз че было, я грешу на кривость сборки бинарников...

Попробуй короче принудительно переустановить.