как заставить appimage загружаться от рута?

в чем проблема ваще?

Вангую он засунул запуск AppImage бинарника в юнит, а гуй не появляется, потому что не выставлен DISPLAY для иксов (не в курсе про вейланд), и проблема с доступом, потому что рут.

Лучше не добавлять в юнит, а запустить gnome-session-properties и добавить в автозапуск туда. Использовать sudo и настроить sudoers, чтобы запускало без пароля.

Нужно предоставить ему переменную дисплей, сокет авторизацию и разрешение для рута обращаться к x11

Емнип, его вполне себе можно распаковать и внутри будет исполняемый файл

appimage

от рута

С помощью systemd юнита

Смотри, то что ты извращенец все поняли уже с аппимайджа, дальше можно было не продолжать