Диски похоже логические? Забэкапить то, что на меньшем, одолжив у друга DVD-прожигалку или у подруги внешний USB хард, пустоту зачистить чем угодно (http://members.shaw.ca/bootitng/), man xfs_growfs || xfs_growfs - расширить тот, что побольше, перенести внутрь. А хороших merge утилит для xfs, пока вроде нет.