Halt и Reboot во FreeBSD может выполнять только root

Попробуй в /usr/bin сделать сделать линк: ln -s /usr/sbin reboot и сделай его выполняемым. Ну ты понял мысль.

Нет, этого мало будет ! Надо ещё suid root поставить. Чтобы halt/reboot выполнялся с правами рута. Иначе мощей не хватит.

ИМХО, более идеологически правильным будет правка /etc/sudoers таким образом, чтобы данный юзер (или его группа) имели права на соотв. действия (после чего sudo reboot и т.п.)