обработать строку

Можно сделать так
$your_var=`echo $your_var | tr -d "[A-Z]*[a-z]*"`

ИМХО эту задачу надо решать слегка на более высоком уровне: есть не строка, а поток ввода который через пайп получает вывод другой команды.

Коли так, то не нужно пихать этот поток в переменную и потом с ней мучиться, а просто сказать
PID=`...здесь то что возвращает твою строку...|awk '{print $5}'`
И потом смело можно писать
kill -9 $PID

$ abc="asdfklsajdflkkljfsa 78956"
$ echo ${abc//[^0-9]/}
78956

но

$ abc=asdjkl789akldk889xyz
$ echo ${abc//[^0-9]/}
789889
$ echo $abc | sed -e 's/[^0-9]//g'
789889
$ echo $abc | sed -e 's/^.*[^0-9]\([0-9]\+\).*$/\1/'
889

Но после ps лучше awk-ом или cut-ом

При использовании awk лучше не ссылаться на номер позиции,
вдруг поменяется. Лучше прямо на конец:
$ echo "connection with pid 5674" | awk '{print $NF}'
5674

Достать последнее число из переменной str.

str=${str%[^0-9]*}
str=${str##*[^0-9]}