хоть какая-то помощь

http://math.msu.su/~vvb/2course/Borisenko/CppProjects/GWindow/xintro.html

Да глянь в коньках, как окно создается, разве это проблема?

Я просто туго шарю в Си, а там кода много мне бы простой hello wold на рабочий стол.

тогда зачем тебе си? расширением для гнома делается легко, пример есть из коробки.

Коньки в собственном окне рисуют, это окно болтается поверх окна рабочего стола. Оно даже не прозрачное, по крайней мере у меня, ярлычок под него прячется. При старте коньки в своё окно копируют изображение с рабочего стола и потом выводят на него текст. Ищи примеры работы с библиотекой cairo, например.

тогда зачем тебе си? расширением для гнома делается легко, пример есть из коробки.

Вот так и появляются программисты на джава...

А причем Gnome к Java? Расширения Gnome обычно пишут на JS.