Например, obkey. Прожка для настраивания хоткеев в OpenBox. Для нее нет deb-пакета, просто набирается sudo setup.py install. Вопрос - как потом правильно снести такую программу? Ее же в пакетном менеджере нет, ее зависимости ни где не прописаны. Вот.