Кажется наврал про федору, они gtk2 как-то подкрутили, чтобы он на gtk3 был похож.
В репах есть pidgin 3.0.0, он еще не релизнулся, но там уже есть поддержка gtk3. Вот инфа по релизу: https://developer.pidgin.im/wiki/Roadmap3.0.0 Уже почти все готово, в том числе gtk3.