Как импортировать почтовые аккаунты из Evolution в Thunderbird?

>несколько
Вручную.
Вот когда будет «много», надо думать.

Речь про учётные записи или письма?

Использовать IMAP и не париться. (если вопрос в переносе почты)

В недрах ~/.evolution/mail должны лежать файлы с характерными именами Inbox, Sent и т.д.

Ими надо заменить одноименные файлы где-то в ~/.mozilla-thunderbird. Вот как-то так...