запустить приложение свернутым в значек

включить в KMail опцию "показывать иконку в tray". Потом - фтыкать в настройки "специальные параметры окна" kwin - поставить там "для главного окна программы kmail при запуске установить свойство minimized".

Не то. Это - оно просто свернуто в таскбар будет и по клику в трей - свернется в трей а не развернется.