Если у тебя при загрузке автоматом идут иксы - большинство менеджеров умеют "вспоминать" что ты попросил загрузить в прошлый раз. Если ты грузишь иксы через startx то пропиши строку "startkde" в файл ".xinitrc" в домашней директории.
Посмотри файлик /etc/X11/xinit/Xclients - там есть выбор предпочитаемого десктопа. У меня в Редхате он задаётся файлом /etc/sysconfig/desktop, в коем можно прописать KDE или GNOME. Собственно, посмотрев этот файл, ты сам всё поймёшь.