вообще надо иногда доки читать, что бы после апдейтов машина поднималась - у них на сайте все расписано какие пакеты стоит обновлять, а если не знаком с системой, то в сторону отложить;
про обновления ядра тоже написано там и даже скрипт приведен
если уже случилось что система обновилась а выполнить mk_initrd &&lilo не получилось могу помочь советом