Биоинформатика. Поиск информации.

Ну я магистерскую защищал используя один из... Но это был первый блин комом, мы взяли существующий алгоритм и его пришлось дополнять другими, более старыми. В конце-концов вроде как подтвердили. Но я бы не был так однозначен.

Cast DNA_Seq. Axon.

И отдельно cast SSZB, он вообще непомерно крут в этом. Но не знаю, заходит ли он на лор.

Биоинформатика

Это, случаем, не про ведро бактерий на сотни терабайт?

я бы сказал ведро нуклеотидов...Черный властелин)

Спасибо за наводку жаль ЛС нету тут...или я неоптный пользователь linux.org.ru?

То мое сообщение и есть что-то вроде ЛС. Им послалось уведомление. Если увидят - придут в тред ))

Отлично! Вдвойне тогда спасибо!

вот это может быть пригодится

Здесь еще посмотрите.

Я-то тут при чём? Я вообще скромный электрофизиолог, какие у меня алгоритмы сравнения геномов...

На всякий случай, вдруг знаешь )))

Биологов тут все-таки мало, меньше, чем админов и программистов.

Множественное выравнивание это альфа и омега биоинформатики. Нужен бывает еще нечеткий поиск, строковые алгоритмы описаны. Остальное очень сильно зависит от задачи и слабо формализовано. Есть замечательная книжка - genomic perl в черной обложке и верблюдом на дорожном знаке, там алгоритмы показываются прямо в исходниках

А вообще очень полезным скиллом именно по биологии, собственно компьютерная часть там не особо сложная. Есть замечательный форум - molbiol.ru , по биоинформатике и системной биологии там отдельная ветка

в общем книжки могу выслать по мылу (либген лежит) но попозже - сейчас нахожусь в состоянии переезда и инет еще не протянул

Добавил почту в описание профиля если можно буду рад получить литературу. Буду ждать)