Судя по списку пакетов - gnome-desktop-data стоит по дефолту. Мне кажется он просто сменил дистрибьютора в xml после установки указанного пакета.
В бинарники (кроме ogenbrowse) похоже он ничего не вставлял, не перекомпилировал.
Но для надежности хочется весь список пакетов прогнать с верификацией принадлежащих им файлов по MD5 с jaunty средствами APT или еще как-нибудь. На досуге попробую.
Предварительное впечатление, что правил он только текстовики ну и Aurorу переименовал и закопирайтил.