Не видит жесткий диск

Во-первых контроллер должен быть в режиме ahci.

Во-вторых, вы в курсе, что SATA3 это только фишка, в том смысле что реально сам жёсткий диск может передавать данные со скорость в лучшем случае 150 MB/сек.

Пропускная способность SATA 2 - 3 Гбит/сек, что примерно равно 384 МБ/сек, в теории, реальная немного меньше, но в районе 300 МБ/сек есть.

Пропускная способность SATA 3 - 6 Гбит/сек - 768 МБ/сек.

Но обычный жёсткий диск в лучшем случае, если он достаточно новый, новая модель, не сильно нагружен и данные на нём не фрагментированы может выдать производительность (скорость обмена данными) максимально в районе 150 МБ/сек. Как видите эта производительность в два раза меньше чем может «пропустить» интерфейс SATA 2 и в 4, а то и 5 раз меньше, если учитывать то, что ближе к краям пластин диска данные считываются медленнее, меньше скорости SATA 3.

Так что SATA 3 нет насущной необходимости использовать, т.к. всё равно жёсткий диск не может выдать такую скорость передачи данных.

Так что смело подключайте диск к SATA 2, ваш Windows 7 сможет загрузиться даже с другого SATA порта и ставьте Linux.

Но для начала всё же попробуйте переключить контроллер в AHCI.

Затем после установки попробуйте обновить систему.

Просто подключи хард к SATA2. SATA3 создан с прицелом на SSD.