RAID1

Ничо не будет. Ну можа винты сгорят, или там мать. Фигня, одним словом.

А с какого рожна они должны сгореть? С перепугу что-ли? Данные потеряются или нет?

если был программный raid то все останется как было, при условии что в ядре будет поддержка нового контроллера и он сам не постарается сделать сразу из этих винтов какой-нибудь свой raid.

если был аппаратный raid, то наверное ничего работать не будет.

Как был сделан райд? Программными средствами или через dmraid и "биос" контроллера?

Определятся как обычные диски. Старый рейд не сохранится.

Через утилиты БИОС во время запуска. А как отличить програмный от аппаратного?

В FAQ написано.

http://linuxmafia.com/faq/Hardware/sata.html

А у меня FreeBSD... И что мне дает это FAQ?

Если ты научишься читать по аглицки и понимать прочитанное, то этот фак возможно даст тебе понимание того, какие RAID-контроллеры являются настоящими, а какие фейковыми.