Скорее всего, касается только Fedora.
1. Качаем .torrent
2. Указываем любую папку для загрузки.
3. Ждем окончания скачивания.
4. Что бы ни указали в п.2, видим свои файлы в /home/username/
Запилю багрепорт, если проявляется еще хоть у кого-то, если нет - ищу проблему у себя.
P.S. проблема появилась, как мне кажется, после долгожданного обновления до 1.3.5.