свежесозданный ext4 раздел уже чем-то занят

Так и должно быть. ФС резервирует место для своих нужд.

tune2fs -m0 /dev/mapper/vgName-lvName

уберет резервирование блоков для рута

Я правильно понимаю, что это самое резервирование нужно только при использовании данной ФС как «/»?

Нет. И резервировать можно не только для root:root.

У меня ничего не зарезервировано, все нормально работает.

По идее желательно иметь какую то часть зарезервированной, но даже 1GB это много для этой цели.
2% осталось видимо как пережиток времен, когда винты были размером с гиг.

У меня ничего не зарезервировано, все нормально работает.

Естественно. И будет продолжать работать пока место не кончится. Вот тут-то и вспомните о резервировании. :-)

tune2fs позволяет выставить зарезервировать доли процента. У себя на / так и делаю. На ~ оно вообще не нужно.

И добавить лишний повод для фрагментации при полном заполнении, ага.

А причём тут резерв inodes? На доступном для использования пространстве он едва ли заметно отразится.

при полном заполнении фрагментация тебя будет волновать в последнюю очередь
да даже с ним она будет оооочень большая
а вообще ни одна фс не любит забитых разделов - даже на 80-85% забитый раздел - ССЗБ

[root@rei ra]# tune2fs -m10 /dev/mapper/vg-home 
tune2fs 1.42 (29-Nov-2011)
Setting reserved blocks percentage to 10% (4800614 blocks)
[root@rei ra]# df -h | grep home
/dev/mapper/vg-home  181G   68G   95G  42% /home
[root@rei ra]# tune2fs -m0 /dev/mapper/vg-home 
tune2fs 1.42 (29-Nov-2011)
Setting reserved blocks percentage to 0% (0 blocks)
[root@rei ra]# df -h | grep home
/dev/mapper/vg-home  181G   68G  113G  38% /home

напомню порядок столбцов в df:

Filesystem           Size  Used Avail Use% Mounted on