Статья бред наркомана - на сайте валяется готовый geexbox-generator, и нечего изващаться. Кстати, я бы лучше дождался geexbox 1.0 или хотябы 0.99 - уж слишком много они к релизам обещали.
В линуксе не монтируется RW. WinISO изменяет изошники так, что при удалении файла (хоть гигабайт) размер ISO не меняется. Так что лучше извлечь содержимое и загрузчик диска, собрать новый образ.