Где можно WMaker'у в автозапуск прогу засунуть?

припиши их запуск в ~/.xinitrc

Залезь в настройки - там где-то прописывается.
В крайнем случае, если я глючу, поставь запоминать состояние
при выходе или просто запомни состояние с запущенным
gkrellm.

~/GNUStep/Library/WindowMaker/autostart я мог ошибиться но окрестность та.

find ~/GNUStep -name autostart

пасибо всем ;)