FreeBSD

1) Что подразумевается под автозагрузкой?
2) Зачем? Что за карточка, может она системой поддерживается?
3.1) /sys - symbolic link на /usr/src/sys , только надо их установить перед этим, само сабой.
3.2) В /sys/i386/conf/ лежат полезные файлы:

GENERIC - это каркас ядра, рекомедную переименовать во что-либо свое и отредактировать
LINT - список возможных опций конфига ядра

После редактирования конфига ядра (удалить все ненужное и добавить из LINT все нужное, если чего-то нет) нужно сказать

config ИМЯ_КОНФИГА_ЯДРА
cd ../../compile/ИМЯ_КОНФИГА_ЯДРА
make depend all install , по желанию можно заменить на make depend all install && reboot

И настоятельно советую прочитать хотя бы FAQ, хотя бы на русском

не переименовать, а скопировать, конечно.
GENERIC лучше оставить в оригинальном виде, как пример.

Автозагрузка - /etc/rc.local (туда прямо команду что грузить пишешь и все)

ЧЕГО????
Какой нахрен rc.local????
rc.conf форева!