ни в коем случае - для терминальных сессий vnc категорически не подходит - тормоза, и куча ограничений - вот какой нибудь X-Server более подходит
Кстати формулировка очень скомкана - автор, объясни подробнее - как я знаю 1С клиентской части под Linux нет и не предвидится - какой же тогда смысл коннектится к серверу?