Нужно подправить PARTITION_CONFIG на emmc чипе в 0x00.
Есть готовый дистрибутив с рабочим mmc_utils, но там старая версия (которая не умеет сбрасывать PARTITION_CONFIG в 0x00)
Запустил liveusb xubuntu 18.04
Подпаял к картридеру чип, установил mmc-utils
root@xubuntu:/home/xubuntu/Desktop# mmc bootpart enable 0 0 /dev/mmcblk1
ioctl: Invalid or incomplete multibyte or wide character
Could not read EXT_CSD from /dev/mmcblk1
mmc extcsd read приводит к тому же результату.
Пробовал ещё debian 9 и fedora 29 - то же самое.