Можно просто перейти в директорию $(srcdir)/po и выполнить
$make update
Если все правильно, то должен создаться файл .pot. Кроме того, нужно не забыть заполнить файл POTFILES.in. Вообще напрямую его делать необязательно, можно например создать ru.po с помощью
$make update ru
Если же напрямую, то этот файл можно сделать с помощью команды xgettext