kcontrol -> Компоненты -> Быстродействие -> Система -> [x] Отключить проверку конфигурации системы при запуске
Потом в ~/.kderc в секцию [General] добавить CheckSycoca=false
P.S. Первое, по моему, срабатывает только если окружение KDE, если нет - его можно проигнорировать, а второе работает всюду. Но поэкспериментировать с этими делами можно.