Проприетарные дрова nvidia моделайны почти не понимают. У меня моделайнами можно только частоту обновления менять. Так что:
1) совет в ЛОР-стиле: Сноси винду!!!11
2) нормальный совет: привыкай двигать изображение ручками при перезагрузке из одной системы в другую или поковыряй виндозные настройки чтоб сдвинуть изображение.
А как насчёт прилагаемой к драйверам программы, которая эти modeline считает и в xorg.conf добавяет? (xorg.conf, правда, уродует.) Название не помню, доберусь домой -- скажу.
Ну а мне драйвера еще поставили nvidia-config (вроде так называется), что-то типа панели управления. Ей никак не получится? На первый взгляд я не нашел, но вдруг плохо копал...
Гуёвая программа на GTK? По-моему -- она. Насколько я помню (пользовался всего раз), она предлагает всевозможные модлайны для любых разрешений и частот, позволяет их все проверить. Затем пишет новый xorg.conf с выбранными значениями.
Недостатки той версии, которой я пользовался (написал в Nvidia, обешали исправить):
1) Запускать только от рута или через sudo, т.к. пишет сразу в /etc/X11/xorg.conf, при ошибке записи не предупреждает.
2) Лучше сохранить старый xorg.conf и вручную перенести в него новые строки, т.к. программа непонятным образом тасует секции и комментарии.