fvwm2

Прозрачность панелек достигается установкой правильных colorset'ов с RootTransparent'ом на соответствующие элементы. Например:

Colorset 1      RootTransparent buffer, bg average, fg rgb:ff/ff/ff 
Colorset 2      RootTransparent buffer, Tint white 20, bgTint black 20, bg average, fg rgb:ff/ff/ff
Colorset 3      RootTransparent buffer, Tint white 50, bgTint white 50, bg average, fg rgb:ff/ff/ff
Colorset 4      RootTransparent buffer, Tint white 25, bgTint white 25, bg average, fg rgb:ff/ff/ff

*FvwmPager:             Colorset * 1
*FvwmPager:             HilightColorset * 2
*FvwmPager:             WindowColorsets 4 3

Для прозрачности менюшек нужно накатывать translucency patch (http://www.fvwm.org -> Wiki)