Как сохранить позицию курсора при выравнивании кода ?

Сохранить позицию перед ее изменением. Команды gg и G меняют позицию курсора - начало документа и конец документа.

Для форматирования кода я рекомендую использовать Chiel92/vim-autoformat.

Программировать в IDE

Делаю выравнивание кода

gg=G
Вим хороший редактор и ему не надо выделять область над которой что-то надо сделать.

Хотелось бы, чтобы после выравнивания курсор стоял на той же позиции.

Ctrl-o

Отчевожесударь, надрачивать на свистелки перделки и окошечкисвойствобъекта можно и в виме...

Например, так (метка будет затёрта):

magg=G`a