винду на удалённый сервер

пробросить гуй через ssh и ставить.

не понял кто из FreeBSD и винды будет хостом и кто гостем. В любом случае установи гостя в виртуальной машине на компе на котором сейчас сидишь, а потом просто залей куда надо образ этой виртуалки.

а еще у virtualbox есть консольный интерфейс (vboxmanage если не ошибаюсь)

я через него ставил...

Потсавить vmware server 2, через web-морду ставь что хочешь. На хосте открой порты 902, 8222, 8333.