Недавно перешел с vmware-workstation на vmware-server (основная причина - отказаться от вареза). Никаких неудобств и проблем не обнаружено. Host-система Fedora9, Guest-система Win2000.
Единственная разница - нет на гостевой системе Shared Folder "искаропки". Но эта возможность легко создается при помощи штатных средств Samba.