Re:

тут от дистрибутива зависит
linuxconf например
хотя по мне руками проще.

по большей части в линуксах RedHat-семейства в каталоге уровня запуска /etc/rc.d/rc.3 (для текстового сетевого режима) или /etc/rc.d/rc.5 (для графического) меняются названия символических ссылок на скрипты запуска. Названия составные. Начинающиеся на "K" означают отстанов сервиса в этом режиме, а начинающиеся с "S" - запуск. Далее следует двухзначный номер вызова данного скрипта (по возрастанию). Далее мнемоническое обозначение сервиса (чтоб понятно было) К примеру S80sendmail означает, что его нужно стартовать после номеров 1-79 (если такие есть) и до номеров (81-99)... 99-м обычно запускается /etc/rc.d/rc.local, где в свою очередь тоже надо просмотреть порядок запуска.