Если компилил сам, то в дистрибутиве есть support-files/mysql.server
Очень удобно - mysql.server {start|stop}
Только не забудь chmod u+x mysql.server , а то он почему-то 0644 :)
В нем же и
mysql_daemon_user=mysql
можно написать, ну и прочие настройки...