Делать этого никому не рекомендую, но если в системе обновления файловой системы сделать минимальными, к примеру отключить временно сервер, то можно sshfs <host>:/ /mnt/<куда ты там хочешь>. Таким образом можно tar-ом тупо архивчик сделать.

стабильность не гарантирую.

Так же как и любой другой linux. tar | ssh вам в помощь. или rsync. вобщем по вкусу. Только не забывайте что если есть пишущие демоны, например СУБД, то это чревато, их перед бэкапом надо останавливать или родными средствами бэкап производить отдельно.

Делать этого никому не рекомендую...

Все верно вы описали! Я поддиванный сервак почти так бэкаплю уже много лет. И не только бэкапил, но и разворачивал при смерти харда. Так что проверено. Вообще в работе если ничего кроме записи логов не оставляем, на горячую нормальный вариант.
ЗЫ Немного не в тему, но: И кстати для бэкапа mac os x tar остается единственно правильным вариантом, (т.к. родная Time Machine не все копирует). ИЧСХ разворачивается из этого tar-а :)

Всем спасибо. Указали в нужную сторону.

LVM

Очень просто. Ставим всё на логический том, делаем снимок, качаем по ssh. PROFIT.

Всё оно копирует.

Нет. О чем на сайте ябла есть упоминание, как минимум не все из Library. Аргументация ябла, что мы не за весь сторонний софт можем отвечать и поэтому часть каталогов стороннего софта не копируем.

Library есть два: системный и пользовательский.

~
сорри забыл приписать в ответе.