Добавь вначале своего скрипта комментарий с полями chkconfig, description и т.п. как это сделано в остальных скриптах /etc/rc.d/init.d/* И все будет работать.
Из /etc/rc.d/rc3.d/ сделай символическую ссылку S_NN_name на /etc/rc.d/init.d/scr_name. В ссылке S-значить что данный скрипт запускается, NN-номер, name - имя ссылки.
2 Alone
> S_NN_name на /etc/rc.d/init.d/scr_name
> В ссылке S-значить что данный скрипт запускается
S значит что даный скрипт запускаеться с параметром start
K соответственно с параметром stop