Net имеет плюшки в сравнении с Явой, только под виндой (wpf, native и вот это вот все) и то они бесполезны для труЪ сервисов, под линухом Net не предлагает ничего интересного, в то время как кастомных Ява-машин полно и у того-же гугла есть своя вм, а в кастом-net надо инвестировать по новой.